Aprovechando que ya tienes el TMPGEnc, puedes hacerlo con él
www.mundodivx.com/aviavcd/tmpgenc.php
Ese manual está explicado para archivos AVI, pero es exactamente igual para tu MPG.
O sea, primero tienes que copiar el archivo DAT del CD al disco duro, y luego le cambias la extensión a .MPG para poder usarlo con el tmpgenc.