Hola
Lo mejor es que borres absolutamente todos los codec y packs que tengas instalados, luego reinicia, y por fin instalate sólo los codec básicos: DivX y XviD para video, y OGG y AC3 para audio. Con eso te sobra para la mayoria de las pelis.
En cuanto a la diferencia entre esos formatos, te remito a esta tabla:
www.mundodivx.com/public/foros/tabla.php
Un saludo