Ok. Si lo que quieres es obtener video y audio separados, puedes hacer una cosa. En el TMPGEnc hay una opción MPEG Tools en el menú File. Ve ahí, y en la nueva ventana que se abre, selecciona De-Multiplex. Ahí cargas el MPG que tiene sonido y audio juntos. Luego haces doble click encima del video y guardas, y lo mismo para audio. El audio lo guardarás en formato MP2, y el video en formato M1V (MPEG-1) o M2V (MPEG-2)
Respecto a hacer un CVCD con TMPGEnc, te remito a esto (es un poco largo de explicar)
http://www.mundodivx.com/public/foro...=3277&start=30
Espero que te sirva