No se si estoy bien

[marcosjoel]

Si trabajas con Photoshop, debes crear una capa máscara a la capa que contiene la imagen. Dentro de aquella pintas con la herramienta que quieras (pincel, degaradao).
Funciona así, por lo gral, cuando pintas con negro es como si borraras y deja ver lo que hay debajo(transparencia), el blanco hace lo contrario.
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Si lo que quieres es para la web, un consejo es que lo que quieras que sea transparente lo pintes de un color similar al fondo donde irá, (si el fdo. es complicado, elige el color predominante), y luego al exportarlo como gif selecciones dicho color como transparente.
Lo del color es para que no se noten píxels "sucios" contra los bordes de la imagen.