Holas..
antes que todo deberias de decir que FTP server usasas; pero creo que todos no dejan hacer login a root es decir por motivos de seguridad ya que este no encripta la info a menos de que uses el SFTP mas info (
www.google.com) para que cada vez que te loges entres a /var/www/html pues depende del server FTP...
pero yo lo que haria es dar permisos a /var/www/html para que los usuarios puedan escribir en el o algun grupo determinado...
y/o crear directorios dentro de /var/www/html/ para cada uno de los usuarios! y asi cada uno pegaria las cosas en su directorio...
Te envio estos links por si te sirven de algo:
http://bulma.net/body.phtml?nIdNoticia=1344 http://bulma.net/body.phtml?nIdNoticia=617 http://www.linuxparatodos.net/linux/09-como-vsftpd.php
Suerte!