Hola de nuevo
mira, creo que este script te puede servir para lo que quieres hacer....
<script language="JavaScript" type="text/javascript">
var abierta = false
var ventana
function abre(cual){
if(abierta){cierra()}
ventana = window.open(cual,'ventana','width=200,height=200')
abierta = true
}
function cierra(){
if(abierta){ventana.close(); abierta=false}
}
window.onunload = cierra
</script>
</head>
<body>
<a href='#' onclick="abre('pagina1.htm');return false;"> abrir popup1 </a>
<br />
<a href='#' onclick="abre('pagina2.htm');return false;"> abrir popup2 </a>
</body>
</html>
Dime si te sirvió