Bien, por fin... mi duda existencial de los popups se ha aclarado.
Un aplauso.. de to agradezco de corazón.
Gracias por tu ayuda, reconozco que lo que me has comentado es básico para entender a usar javascript.
Si quisiera cerrar un popup anterior, para abrir uno nuevo, cuando hago click en un link. En este caso no hacemos una recarga de la pagina principal. I por tanto no perdemos ninguna variable, si que seria viable.
Esta seria la forma correcta?
<a href='#' onclick="var nueva; if (nueva) nueva.close(); nueva=window.open('','nueva',''); return false;"> abrir popup1 </a>
<br />
<a href='#' onclick="var nueva; if (nueva) nueva.close(); nueva=window.open('','nueva',''); return false;"> abrir popup2 </a>