Acabo de probar el código tal y como lo pusiste
<a href='#' onclick="nuevaventana=window.open('','_new','');"> abrir popup </a>
y la verdad es que me lo ha abierto de inmediato.
Tal vez sea una cuestión propia, o bien que tienes la compu mareada (la mía se marea cada pocas horas y he de rebotarla
) o bien hay algo que provoca esa demora.
Es como en mi compu, usando dreamweaver, desde que le pido "nuevo" hasta que me lo abre puedo irme a dar una vuelta por ahí en lo que espero y no tengo idea de por qué se comporta así.
Has probado con otro navegador o desde otra computadora?