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Hay un ejemplo para crear thumbnails ... Si el problema que tienes es que ves muchos ejemplos que "entregan" esa imagen al navegador para mostrarla y tu sólo quieres guardarla .. recueda quita las menciones a cabeceras HTTP que aparezca en los código que uses (header("content-type ....") y que la función imagecreateXXX() y similares tiene un 2º parámetro normalmente para indicar la ruta donde quieres guardar tu imagen generada. (revisa el manual de php para ver la documentación de cada función
www.php.net/gd)
Un saludo,