Si le vas a instalar 98 y te urge, podrías sacar el HD, conectarlo como esclavo en la otra que está trabajando y copiar el directorio win98. Luego lo volves a poner como maestro en su propio CPU, inicias con un diskette DOS, te pasas a C: entras al directorio y ejecutas instalar o setup (si esta en inglés).
Si queres buscar alguna alternativa para hacerlo por red, fijate en este tema
equipos desde la red