mira, creo que andas un poco confundido de lo que es linux, antes de intentar meterte en este "mundo" deberias de documentarte acerca de linux y el software libre, ve a esta dirección
Linux-es.com y date una vuelta por las faq´s.
Respecto a la compatibilidad entre linux y aplicaciones windows no se puede hablar nada, ya que no existe dicha compatibilidad. Linux y Windows tienen sistema de archivos completamente distintos así que una aplicación para windows no te servirá para linux, pero bien es cierto que existen multitud de aplicaciones análogas en linux que funcionan perfectamente o incluso mejor.
ejemplo:
WINDOWS LINUX
Winamp XMMS
Media player Mplayer, Xine
Inter. Explorer Galeon, Mozilla
Office OpenOffice, koficce, ...
Winzip GnoZip
etc...
Espero servirte de ayuda.
Salu2.