Antes de que te intenes compilar al wine en tu linux, seria buena idea que verificaras que no hay paquetes para tu distribucion de linux con el caso de debian o redhat.
A hora si no hay otra opcion que compilar, entonces lee bien las instrucciones, si a un asi hay algun error entoces agrega aqui el mensaje de error para que podamos tener una clara idea de tu caso.
Como quiera si es bueno que visites la pagina oficial para mas detalles. Aqui te dejo la liga para la guie del usuario.
http://www.winehq.com/site/docs/wine-user/index