Hola, Copp:
- Si la imagen final es para la web sólo tienes que comenzar un documento nuevo con fondo transparente, escribir el texto (que creará una capa) y hacer Archivo/Guardar para Web. Guardas como formato GIF con transparencia y ya está.
- Si lo vas a imprimir, cada uno tiene su truco

. Yo siempre que deseo transparencias hago un trazado de recorte alrededor de la imagen que quiero que se vea y la guardo como Photoshop EPS con codificación ASII (trabajo con Quark y me avisa sin son binarias). Si necesito otras opciones elijo DCS 1.0 o DCS 2.0, este último se tengo tintas planas.
A ver si ésto te puede servir de guía y no te lío mucho