Hola, edwinandlozano.
Puedes meter los checkbox en un formulario:
<form name="frm">
<input type="checkbox...
</form>
Y poner la función de esta forma:
function SetCheckbox(checked) {
elem=frm.elements;
for(i=0;i<elem.length;i++)
elem[i].checked=checked;
Espero que te sirva. Saludos,