En tu código HTML debe de aparecer algo así:
Código:
Mi contador de visitas: <!--#include virtual="/ruta/a/contador.cgi"-->
ó
Código:
Mi contador de visitas: <!--#exec cgi="/ruta/a/contador.cgi"-->
Te recomienda que vuelvas a leer el artículo que tienes acerca de los SSI pues ahí debe de estar lo que te acabo de mostrar.
SALUDOS