Bueno, es tan sencillo como poner:
Código PHP:
if (isset($_GET['sec'])) {
header("Location: {$_GET['sec']}.php");
exit;
}
// aqui el resto de tu index
Esto para cuando no pasas parametro.
Lo otro no entiendo muy bien. ¿Quieres que algunos parametros te haga el include y otros la redireccion?
Saludos.