Holas...
entra en modo texto...
y checa el fichero de conf de GDM si es este el que usas...
/etc/X11/gdm/gdm.conf
y busca la linea
[security]
y coloca en enable lo de ROOTGDMLOGIN o algo asi! es bien intuitivo
PD: se recominda no utilizar la cuenta de root, solo usala para cosas que solo root pueda hacer y para eso te creas un usuario normal con el cual haces un
#su - root -c "/path/comand/soloroot "
ó
#su -
password: *****
#[root]$/path/comand/soloroot
#exit
Suerte!