El servidor de del grupo Apache con soporte Java (para páginas JSP y Servlet) es TOMCAT ..
Puedes ver más información al respecto en el proyecto Jakarta:
http://jakarta.apache.org/
Tomcat
http://jakarta.apache.org/tomcat/index.html
Lo que no sé es si a Tomcat se le pueden agregar otros módulos de lenguajes del lado del servidor .. me refiero a PHP y Perl por ejemplo y que todo conviva bien con el soporte JAVA ..
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Interchange Cart ... si google no me engaña es una aplicación CGI (en Perl?) de "tienda virtual" propietaria de RedHad? ..
Bueno, en tal caso al ser una aplicación CGI (creo) sería recomendable que si tienes dudas en su instalación preguntases en el foro de "CGI's"...
Un saludo,