Es mucho mas sencillo.. tienes el Apache por RPM (1.3.x) instalado y ahora el Apache2, para que no tengas ningun problema lo mejor es hacer una desinstalacion limpia del primero.
Primero mira a ver que Apache por rpm tienes :
"rpm -q apache"
y despues desinstalalo :
"rpm -e --nodeps apache*"
No te preocupes que no interfiere para nada con tu nuevo apache2.
** Si prefieres tener los dos y jugar con el segundo solamente, con parar el del rpm vale.
"/etc/init.d/httpd stop"
Si quieres que se apage siempre al iniciar el server edita el fichero
"/etc/rc.d/rc.local" y mete ahí la linea.