JOSEMI: "ya asignado para tus aplicaciones cuando no sea el servicio asignado (no uses el puerto 80 para tu servidor FTP)."
cuando digo que se puede es porque técnicamente se puede, claro está que no es recomendable, pero podemos usar cualquier puerto para un servidor ftp, http, etc. otra cosa es que el cliente lo encuentre.. si le digo a mi primo que mi servidor ftp está en el puerto 80 y el apunta su cliente ftp a mi host:80 pues lo encontrará sin problema. Como bien dices esto no es nada recomendable, para eso están las recomendaciones de puertos para servicios por defecto, que si alguien tiene curiosidad de consultar:
http://www.iana.org/assignments/port-numbers