Hola nuevo.
Trata asi:
Código PHP:
<script language="javascript">
var miventana;
function abrir(){
miventana = window.open("html/graficos.online.visitas.banner.inc.php?accion=graficos&id=$nweb","ventana","Width=300,height=320,left=450,right=300");
}
function tiempo(){
settimeout("miventana.close()",45000);
}
</script>
<a href="cuenta.voto.php?accion=votar&id=$nweb" target="_blank" OnMouseOut="tiempo()" OnmouseOver="abrir()">
Además, si quieres que tu popup siempre esté en foco, una aproximación es que le pongas en el tag body (del popup) lo siguiente:
<body onblur="focus()">
Saludos.