Hola acervantes:
Creo que siempre que exista un "parentezco" puedes hacerlo...
Si la abres como popup:
var ventana = "window.open('pagina2.htm', '', '')"
ventana.document.frames[0].src = "frame0.html";
ventana.document.frames[1].src = "frame1.html";
creo que también puedes usar en vez de src location.href...
Saludos