Así sin ver el código es difícil saber que puede pasar
Yo miraría el código por si hay algun salto de línea <BR> o algún salto de parrafo <P>... porque a veces se cuelan y no lo vemos.
Otra opción, es que empieces desde el principio a ponerlo todo; empezando por las tablas en Dreamweaver y mires cuanto ocupa la celda tanto de ancho como de alto y modificar el boton Flash con la medida de la celda por si acaso ocupa mas espacio de lo que mide la celda.
No se me ocurre ninguna otra cosa de momento que pueda ser, si subes la pagina te podré ayudar mas... ya nos contarás...
Salu2 y suerte