Para compiar el kernel necesitas en primer lugar el kernel-source instalado.
Una vez chequeado eso usas los siguientes comandos:
cd /usr/src/linux
make xconfig
#este comando te servira para configurar el kernel en un modo #grafico, donde podras usar el mouse
make menuconfig
#con esta opcion podras compilar muy facilmente, aqui no usas mouse
cuando termines salvas los cambios y haces
make dep
make clean
make bzImage
make modules
make modules_install
luego tienes que copiar los archivos generados a la rama /boot
configuras tu gestor de arranque y lo activas.
para que tengas mas info te dejo este link en espanol:
http://es.tldp.org/COMO-INSFLUG/COMOs/Kernel-Como/
lee este HOW TO ANTES DE HACER CUALQUIER CAMBIO A TU SISTEMA Y TE RECOMIENDO, QUE TENGAS BACKUPS DE TODOS TUS FILES IMPORTANTES.
Suerte!!!
