A ver. En la faq nº55 no tienes que cambiar nada.
El código javascript, lo pones en el head de tu página. (tal y como está)
Y para hacer los enlaces, lo unico que tienes que poner es el nombre de tu imágen:
<a href="#" onClick="afoto('
nombre_de_la_imagen_de_tamaño_grande.jpg');return false"><img src="
nombre_de_la_imagen_en_miniatura.jpg"></a>
Espero que hayas entendido.