Código PHP:
$result = mysqli_query($conectar, "SELECT dom.nombres, cli.name_client, tr.valor_base, tr.estado, dom.domiciliary_id, tr.transport_id
FROM transport_table_xeb as tr
INNER JOIN create_domiciliary_xeb as dom ON tr.domiciliary_id=dom.domiciliary_id
INNER JOIN create_client_xeb as cli ON tr.client_id=cli.client_id; where domiciliary_id='".$_SESSION['domiciliary_id']."'");
Amigo aqui esta toda la consulta. Lo hice como dijiste y nada. Como dije anteriormente, la session me funciona correctamente sin el inner join