Código PHP:
$idCuenta = 'porque';
$nombreCuenta = '1';
echo '<script>var idCuenta ='.$idCuenta.'; </script>';
echo '<script>var nombreCuenta ='.$nombreCuenta.'; </script>';
echo '<script src="custom/modules/Emails/Javascript/controladorEmails.js"></script>';
Estás pasando la variable así
var idCuenta =porque;
cuando deberías de pasarla así
var idCuenta ='porque';
Prueba a ponerlo por ejemplo así
Código:
echo "<script>var idCuenta ='".$idCuenta."'; </script>";