ahora que veo mas detenidamente tu codigo, veo que podrias hacer esa comparacion dentro de la consulta MYSQL y solo ver si existe 1 registro que coincida
Código PHP:
Ver original<?php
"SELECT origen, destino
FROM registro
WHERE dni = '".$_SESSION['dni_input']."'
AND origen= '".$_POST['origen']."'
AND destino= '".$_POST['destino']."'
LIMIT 0,1;
");
echo "YA SE EMITIÓ UN BOLETO CON ESTE TRAMO";
echo '<a href="index.php">VOLVER</a>';
}else{
echo "CODIGO de IMPRESION";
}
?>
ese COdigo es ilustrativo tiene fallos de seguridad, te podrian meter un SQL Injection. asi que procura limpiar las variables POST antes de usarlas