hay muchas formas, pero creo que la mejor es la de creando otro array, y luego mostrar el JSON
pero con lo que tienes ahora, solo es cuestion de controlarlo con unas variables y los bucles
Código PHP:
Ver original<?php
$url = "https://rafelcf.000webhostapp.com/rafel_cf/1.php";
echo '[' ;
$coma='';
foreach ($pendientes as $indice => $valor) {
foreach($valor as $indice1 => $valor1){
if($valor1 == "Pendiente"){
echo $coma;
$coma=',';
break;
}
}
}
echo ']';
?>