Ambos archivos son un CSV solo cambia el formato de la extención, por lo que asumo que al cargar el txt que mencionas lo haces desde el PHPMyAdmin, cosa que este tiene que cargarlo, parsearlo y cargarlo en una serie de sentencias INSERT para correrlas y guardar los datos.
en cambio la segunda opción que mencionas
LOAD DATA INFILE es una query de MySQL que trabaja completamente independiente a PHPMyAdmin.