Eso nunca va a funcionar porque estás intentando leer directamente una variable de PHP en JavaScript. Recuerda que PHP trabaja del lado del servidor mientras que JavaScript lo hace del lado del cliente.
Sería más fácil si asignaras ese valor a un
<input type="hidden">, es decir, un campo oculto, para que así lo puedas seleccionar mediante JavaScript, leer su valor y evaluar la condición.
