¿ Distribuir programa Java con Base de datos ?

[Jaime_Alons]

SQLite para una aplicación de escritorio no está mal y menos dolores de cabeza, por otro lado si te decantas por MySQL está la opción de descargar el XAMP portable, eliminas lo que no necesites configuras (eliminar contraseñas por defecto...) y listo. Junto con el arranque de la aplicación tendrías que arrancar el servicio mysql y al cerrar obviamente pararlo.
Incluye un servidor apache + phpmyadmin para que puedas gestionar la base de datos de forma visual directamente en el ordenador del cliente y no instalar el mysql workbench.