Problema con if anidados

[Joseph]

Tengo un problema al ejecutar if anidados, al ejecutar y encontrar resultados se muestra que no hay horarios disponibles y muestra el resultado... y si no encuentra resultados me muestra dos veces que no hay horarios disponibles sin mostrar resultados.

Les dejo el código a ver si pueden ayudarme:

Código PHP:

<script src="../js/search.js"></script>
 
<?php
 
include "conexion.php";
 
 
$sql1= "select * from horario INNER JOIN user ON horario.id_docente = user.id INNER JOIN materia ON horario.id_materia = materia.id INNER JOIN aula ON horario.id_aula = aula.id INNER JOIN seccion ON horario.id_seccion = seccion.id INNER JOIN turno ON horario.id_turno = turno.id";
$query = $con->query($sql1);?>
 
<div>
  <form>
     <input  class="form-control" id="searchTerm" type="text" onkeyup="doSearch()" placeholder="Escriba aquí la palabra a buscar..."/> 
  </form>
</div>
 
<?php if($query->num_rows>0):?>
<table class="table table-bordered table-hover" id="search">
<thead>
    <th>Docente</th>
    <th>Materia</th>
    <th>Aula</th>
    <th>Sección</th>
    <th>Turno</th>
    <th>Día</th>
    <th>Hora de Inicio</th>
    <th>Hora de Fin</th>
    <th>Estatus</th>
    <th>Estatus</th>
 
</thead>
<?php while ($r=$query->fetch_array()):
        $materia=$r["id_materia"];
    if ($materia==$_GET["id"]):?>
<tr>
    <td><?php echo $r["name"]; ?></td>
    <td><?php echo $r["materia"]; ?></td>
    <td><?php echo $r["aula"]; ?></td>
    <td><?php echo $r["seccion"]; ?></td>
    <td><?php echo $r["turno"]; ?></td>
    <td><?php echo $r["dia"]; ?></td>
    <td><?php echo $r["hora_inicio"]; ?></td>
    <td><?php echo $r["hora_fin"]; ?></td>
 
    <?php $estatus=$r["estatus"]; if ($estatus): ?> <td><img src="http://www.forosdelweb.com/f18/img/on.jpg" height="30" width="25"> En Clase</td> <?php else:?><td><img src="http://www.forosdelweb.com/f18/img/off.jpg" height="30" width="25"> Ausente</td><?php endif;?>
    
 
 
    <td style="width:150px;">
        <a href="#" id="del-<?php echo $r["id_horario"];?>" class="btn btn-sm btn-danger">Eliminar</a>
        <script>
        $("#del-"+<?php echo $r["id_horario"];?>).click(function(e){
            e.preventDefault();
            p = confirm("Estas seguro?");
            if(p){
                window.location="./eliminarHorario.php?id="+<?php echo $r["id_horario"];?>;
            }
 
        });
        </script>
 
    </td>
 
<?php else:?>
<p class="alert alert-warning">No hay horarios disponibles</p>
<?php endif;?>
</tr>
<?php endwhile;?>
</table>
 
 
<?php endif;?>