Hola jiten,
Si te han dicho en el soporte de GoDaddy que uses el php.ini, lo único que debes hacer es subir un archivo con ese nombre a la raíz de tu sitio (public_html) con el contenido:
Esto te dará una duración de las sesiones de 6 horas, el número indica los segundos, por lo que en base a eso, ya puedes configurarlo como te convenga.