Si dices que tienes dos objetos.
$contenido[0][116] = "true";
$contenido[0][
117] = "false";
y estas probando con los dos
$debug = trim($contenido[0][116], " ");
$debug = trim($contenido[0][
117], " ");
Debería funcionar todo bien, tal vez podrías probar asignándole el valor "true" y luego "false" directamente a la variable $debug para ver si se comporta igual porque no se me ocurre a que se puede deber
. Sorry.