Problema con fadeToggle

[AngelKrak]

puedes hacerlo mediante clicks ;)
https://codepen.io/anon/pen/ENeBNZ

Inicias la variable apagada

Código Javascript:

var click = false;
 

y despues haces una condicion de si la variable esta apagada ejecute X Codigo y la Active, y al volver a hacer click que verifique si esta prendida para apagarla y ponerle otro codigo a ejecutar ;)

Código Javascript:

if (click == false) {
      click = true;
    e.preventDefault();
    menu.slideToggle();
    $(".modal").fadeTo(500, 1);
    $('body').css('overflow', 'hidden');
    } else {
      click = false;
      menu.slideToggle();
      $(".modal").fadeTo(500, 0);
    $('body').css('overflow', 'auto');
    }