Si clase.user.php esta siendo incluido o ejecutado desde otro archivo, por ejemplo index.php incluye a class.user.php que a su vez incluye a dbconfig.php la ruta base tomada para incluir a dbconfig.php será la de index.php y no la de class.user.php.
Yo personalmente prefiero usar rutas absolutas, definiendo la ruta base en una o dos constantes:
Cómo ejemplo:
Código PHP:
define("RAIZ_WEB", 'http://'.$_SERVER['SERVER_NAME'].'/Pruebas/LoginPDO/'); // dirección URL de la web
define("RAIZ", $_SERVER['DOCUMENT_ROOT'].'/Pruebas/LoginPDO/'); // Ruta interna del servidor del servidor
include_once RAIZ.'conexion/dbconfig.php';