No tienes que ponerlo en el .php, sino en la plantilla que uses. Si sólo lo quieres en el índice, modifica el archivo index_body.tpl y pones el código al inicio. Este código te lo darán en el foro de javascript, pero si no recuerdo mal, es algo parecido a esto:
Código:
<script>
window.open("popup.htm","miVentana", "toolbar=no,directories=no,menubar=no,status=no");
</script>
Ese codigo lo pones al inicio del index_body.tpl, pero primero ajustalo a tus necesidades.
Saludos
