Si eso está en un server no debería preocuparte que decompilen el código debería preocuparte de que entraron en tu server. Si eso es una app de escritorio y se conecta una base de datos remota entonces tienes un problema de diseño, para eso se ocupa un webservice.
Si es un server, te recomiendo leer esto:
https://12factor.net/es/
Saludos!