Creo que más bien estás usando la herramienta incorrecta, si no vas a usar PDO para ejecutar las consultas de SQL entonces no lo uses.
Busca una librería o SQL-Builder únicamente, seguramente es lo que necesitas.
A propósito:
Cita: ¿Cómo funcionaba bien la función antes si no le indicabas la conexión?
¿Alguna vez tuviste la intención de leer el manual?
Exactamente ahí de indica la razón de que "funcione", pues sencillamente se crea una conexión con los datos por defecto, sólo que no te enteras.