No desaparece, pero debes tomar en cuenta qque ahora te puedes loguear a ese servidor tanto con la cuenta de admin local como la de admin del dominio, por eso podria parecer de pronto que "cambia", pero en realidad son dos distintas.
Para loguarte localmente te aconsejo poner en usuario. "nombre_servidor\administrador"
Y para de admin del dominio. "
[email protected]" o como se llame tu dominio