Podrias utilizar la funcionalidad "pattern substitution"
http://linux.die.net/man/1/bash (busca
Pattern Substitution en la pagina)
Código BASH:
Ver originalcadena="/usr/local/bin/ffmpeg<>-re<>-reconnect<>lnptsband"
#solo reemplaza la primer ocurrencia
echo ${cadena/<>/ }
#resultado /usr/local/bin/ffmpeg -re<>-reconnect<>lnptsband
#reemplaza todas las ocurrencias
echo ${cadena//<>/ }
#resultado /usr/local/bin/ffmpeg -re -reconnect lnptsband