Cita:
Iniciado por WebTech 
Pues muy simple, a cada uno de tus dominios asígnale los DNS que creaste (ns1, ns2, ns3 y ns4) y allí comenzarán a despacharse a nivel de DNS desde cPanel directamente, y no tendrás que interactuar con Amazon Route 53 :)
Un saludo,
Gracias por tu respuesta.
Si, de hecho eso fue lo primero que hice pero leyendo un poco creo que Route 53 te deja cambiar de DNS pero siempre los parents se van a quedar los asignados por su plataforma.
Parent Nameserver
ns-77.awsdns-09.com
ns-943.awsdns-53.net
etc
Local Nameserver
ns1.midominio.com
ns2.midominio.com
etc
Debería ser al revés. El parent debería ser ns1, ns2 y el local debería ser el ns-77...etc