Bueno pues, resulta que @pateketrueke tenia razón, el problema no era el php, pero uno busca todas las soluciones posibles.
Resulta que el problema estaba en el .jar, entonces como el proveedor de ese jar no aparece por ningún lado me encontré esta belleza
http://www.javadecompilers.com/ y efectivamente el problema era el path quemado con raíz tipo linux.
Gracias @pateketrueke y @xerifandtomas por participar