Como validar email 2 veces en formulario

[Alexis88]

Para evitar que se copie el contenido de la primera caja del email, solo debes detener la ejecución del evento copy:

Código Javascript:

document.form1.email1.addEventListener("copy", function(event){
    event.preventDefault();
}, false);
 

Y para evitar que se pegue el contenido de la primera caja o de otra en la segunda caja del email, solo debes detener la ejecución del evento paste:

Código Javascript:

document.form1.email2.addEventListener("paste", function(event){
    event.preventDefault();
}, false);
 

Como se realiza la misma acción, detener el evento ocurrido utilizando el método .preventDefault(), puedes utilizar una función que ejecutarías en ambos casos:

Código Javascript:

function detener(event){
    event.preventDefault();
}
 
document.form1.email1.addEventListener("copy", detener, false);
document.form1.email2.addEventListener("paste", detener, false);
 

Aunque aparentemente la expresión regular que utilizas es la adecuada, te sugiero utilizar la que se emplea internamente en los <input> de tipo email de HTML5:

Código Regex:

/^[a-zA-Z0-9.!#$%&’*+/=?^_`{|}~-]+@[a-zA-Z0-9-]+(?:\.[a-zA-Z0-9-]+)*$/
 

Y la evaluación la realizarías así:

Código Javascript:

var regex = /^[a-zA-Z0-9.!#$%&’*+/=?^_`{|}~-]+@[a-zA-Z0-9-]+(?:\.[a-zA-Z0-9-]+)*$/,
    email1 = document.form1.email1.value,
    email2 = document.form1.email2.value;
 
if (regex.test(email1) && regex.test(email2)){
    //Instrucciones
}
 

También puedes utilizar el elemento que mencioné para que evites realizar esta validación, así como el uso del atributo required para impedir que se procese el formulario si alguno de sus campos, que posea dicho atributo, no contenga valor alguno.