Obviamente al utilizar un bucle, para actualizar cada registro en lugar de una única consulta, sólo te indica si esa consulta a actualizado (1) o no (0).
Por lo tanto lo que puedes hacer es crear un contador.
Código PHP:
Ver original$actualizar= mysql_query ("UPDATE gestion_doc INNER JOIN ruta ON ruta.id_ruta=gestion_doc.id_ruta SET id_solicitante='$cs',fecha_solicitud='$bn',ruta='$ gd',gd_nota='$fn' WHERE id_gd='$hm'",$conex);
$contador=$contador+$filas_afectadas;
echo $contador;