Imagino que algún uso quieres darle al valor que deseas añadir a la URI de la ventana padre. Pienso que, si deseas ejecutar algún proceso en ella utilizando dicho valor, simplemente podrías asignarlo a alguno de sus elementos, de tal forma que, cuando cierres la ventana emergente, en la ventana padre estará establecido dicho valor en uno de sus elementos, digamos, una caja de texto, así tan solo te quedaría trabajar con él.