Dominio en intranet

[X_fran]

Tienes dos opciones: Windows Server digo esto para instalar un servior DNS, es simple como siempre, clic en siguiente, siguient.
La segunda opción: Bind el servidor DNS por exelencia para linux, tal vez implique algo de investigación, pero creo sería bueno para enriquecer tus conocimientos.
Ahora tu aplicación web, si está desarrollada sobre ASP pues necesitarás IIS como servidor web, así que con Windows Server "matarás dos pájaros de un solo tiro", aunque también puede servir páginas php instalando algún módulo.
Si tu web está desarrollada con php, pues el tipo es Apache, y ese te lo puedes encontrar para linux y para Windows en las plataformas WAMP.
Si tu web está desarrollada con java, pues Apache Tomcat y ese tambien está disponible para ambos Sistemas operativos.