Para el cliente es (en la mayoría de los casos) indiferente si usas un diseñador de interfaces o escribes todo el código a mano. Ahora el asunto es que probablemente el mantenimiento lo hagas tu y mantener código generado por IDEs generalmente da problemas o es más complejo de tener un historial de cambios limpio, así que igual usar un generador de ventanas es un arma de doble filo.
Por otro lado las aplicaciones desktop digamos que son menos populares estos tiempos y cada vez más se hace vía web.
Saludos