Efectivamente como lo indicaron alla arriba la solucion son los [].
Ejemplo que encontre en la red.
Código PHP:
SELECT * from ST_Rel_4.050_Test.dbo.sa_desk
ST_Rel_4.050_Test.dbo.sa_desk nombre de la base con caracteres inusuales.
Código PHP:
SELECT * from [ST_Rel_4.050_Test].[dbo].[sa_desk]
Asi se deberia hacer la consulta.
Saludos y espero te ayude en algo.